口腔中常常寄居着大约20克共生细菌，他们常常能够变成致病菌，而导致龋齿。E.Fisch 博士（1899－1966年）被认为是第一个在口腔科临床实践中应用三氧治疗的学者，喷注三氧水就能够清除所有的化脓性物质和消毒整个部位。三氧能刺激局部血液循环，可能刺激细胞因子的产生，促进伤口的愈合。在国际三氧协会第十五届会议上（IOA,2001年），Filippi博士报道应用三氧化水治疗口腔感染，与安慰剂治疗对比能够明显的加快伤口愈合。然而，由于人类绝不能直接呼吸三氧。直接应用三氧气体仍然应该禁止。

       E.Lynch教授的研究小组发表的《应用新型的三氧发生系统整体治疗龋齿》一文的研究，已经显示应用新型的三氧发生系统能够成功的治疗原发性牙根龋齿损伤，而且可以避免任何毒副作用。整套仪器包括：三氧源和一个可以移动的牙科硅杯，用来将牙齿的损伤部位充分地暴露在气体作用范围之内。三氧的泄漏可以被一个有弹性的、使杯缘能够对着牙齿的特定部位的罩杯来防止。牙齿的损伤部位只要暴露在三氧之下10秒钟就能够充分杀灭原发性牙根龋齿损伤的所有致病菌。十分有趣的是，60％经过应用三氧治疗的原发性牙根龋齿损伤的病人的牙齿变得十分坚硬，这支持过去曾观察到的对于牙根质龋齿损伤，应用氧化剂治疗后可以补充矿物质的研究。

     因此，这种应用三氧的新的治疗方案显示是相当有效的，没有任何副作用，被认为是在原发性牙根龋齿损伤治疗中替代传统方法的有效方法。